Керівництво

Відділ забезпечення діяльності Служби

Сектор охорони державної таємниці, технічного та криптографічного захисту інформації

Слідче управління фінансових розслідувань

Управління боротьби з фінансовими злочинами

Відділ аналітичної роботи, прогнозування та оцінки ризиків

Управління координаційного забезпечення податкової міліції

Відділ роботи з персоналом 

Сектор фінансово-бухгалтерського забезпечення

Сектор правового забезпечення

Сектор матеріально-технічного забезпечення

Управління внутрішньої безпеки

Сектор запобігання та виявлення корупції