01 Управління організації роботи

02 Відділ охорони державної таємниці, технічного та криптографічного захисту інформації

03 Управління матеріального забезпечення та розвитку інфраструктури

04 Управління по роботі з персоналом

05 Управління фінансування, бухгалтерського обліку та звітності

06 Управління внутрішнього аудиту

07 Управління моніторингу доходів та обліково-звітних систем

08 Управління обслуговування платників

09 Управління інформаційних технологій

10 Юридичне управління

12 Управління податків і зборів з юридичних осіб

13 Управління податків і зборів з фізичних осіб

14 Управління аудиту

16 Управління боротьби з відмиванням доходів, одержаних злочинним шляхом

17 Управління погашення боргу

21 Оперативне управління

22 Відділ внутршньої безпеки територіальних органів ДФС у Київській області

23 Слідче управління фінансових розслідувань

25 Спеціаліст з питань запобігання та виявлення корупції

40 Управління контролю за обігом та оподаткуванням підакцизних товарів

50 Білоцерківське відділення

51 Бориспільське відділення

52 Броварське відділення

53 Вишгородське відділення

54 Києво - Святошинське відділення

55 Обухівське відділення

56 Ірпінське відділення